La Giunta è l’organo di indirizzo politico e di programmazione dell’Ente. E’ formata da cinque componenti, compreso il Presidente, scelti e nominati secondo le modalità stabilite dallo Statuto dell’Ente Parco e dalla Legge Regionale n. 33/93 e ss.mm.ii., garantendo, comunque, la rappresentanza di un componente di nomina delle associazioni ambientaliste e di uno di nomina delle associazioni professionali agricole maggiormente rappresentative sul territorio provinciale in cui si trova l’Ente Parco. Gli altri due componenti sono eletti tra i membri dell’assemblea della Comunità del Parco.

La Giunta è nominata con decreto del Presidente della Giunta regionale, su proposta dell’assessore al ramo e dura in carica cinque anni. I suoi componenti possono essere riconfermati.